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一般理解：这是一家民营企业，法人代表是股东。将上千万元资金转到法人代表个人账户，主要存在税务风险。

公司正常的业务往来应该通过公司在银行开立的结算账户办理资金收付，将上千万元资金转到法人代表私人账户，这显然已经超出了正常业务往来的范畴。存在的主要风险如下：

1、个人所得税风险。

公司资金转给法人代表，超过一年时间没有归还的，可以视同股息红利所得，按20%的税率缴纳个人所得税，除非提供证明，证明这笔资金用到了公司的生产经营上。

2、增值税及企业所得税风险。如果没有超过一年，不被认定为股息红利所得，则可能被税务机关按同期银行借款利率计算利息，对公司征收增值税及附加，同时对调整的利息收入计入公司应纳税所得额进行纳税调整。

3、建议。如果这笔资金实际用于公司生产经营，建议及时补充相关证据。否则，建议及时转回公司，或签订借款协议。这样可以降低公司及法人代表双方的涉税风险。

希望我的回答对你有所帮助。