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关于这个问题回答如下：

1.这种情况可能是一种误解。实务中很多公司的确注销了，但是为什么还被税务机关罚款呢？实际上实务遇到的很多案例发现，公司根本没有走正常的税务注销程序，而是被税务机关列入了非正常户。这种代理记账公司代理记账时有发生。一些小公司经营不下去了，认为没有收入就不再申报了，也不在支付代账费用，自然代账公司就不管了。

实务中还有一种情况，就是公司老板给代账公司支付了一笔代理注销费用，可能由于工作失误忘记了 或者注销过程中出现了一些涉税问题，可能有的是代账公司自己的责任，不好给老板交代，直接就放在那里不管了。由于长期不申报被税务机关列入了非正常户。这种情况税务机关如果能够找到公司法定代表人，会要求依法办理政常注销手续，这个过程税务机关需要先转为正常户，才能正常注销。非正常户转为正常户会给予行政处罚。

2.实务中的确也存在办理了正常注销后被税务机关查处的特殊案例。就是税务机关通过检查发现某公司存在大量虚开或者接受虚开发票问题，可能注销检查过程中由于检查人员没有发现或者发现了没有查处。这种情况后续如果检查发现会依法进行查处。如果是一般性质的小问题，一般情况下税务机关不会继续追查处理。

3.提醒一些代理记账的中小企业，如果公司注销，一定要办理税务注销手续，不能一走了之。如果是委托代账公司办理，一定要核实是否取得了税务机关的税务注销通知书，确认已经依法注销。