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这种涉及的情况相对比较复杂一点，不能单纯的来看这个问题。

一、首先看这个分支机构属于子公司还是分公司。

如果是子公司，那么是具有独立的法人资格，可以单独和员工签订劳动合同；如果是分公司，那不具备独立法人资格，所以也不能作为劳动合同的主体，这时候只能是上级公司才是主题。

二、要看劳动关系在哪里建立。

1、如果是上级公司与员工签订了劳动合同，然后通过外派的方式到分公司和子公司上班，且社保在上级公司所在地已购买，这种情况下，分支机构是不用在和员工另外签订劳动合同了。

2、如果是长期在子公司上班，且社保在子公司所在地购买，那么劳动关系原则上应当转移到子公司，并且需要另行签订劳动合同。

3、分公司不管什么情况下，都是与上级公司签订。

三、是否要支付二倍工资，主要就看以上情况来定，如果按规定需要签而没有签才会有二倍工资的情形出现。

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