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可以根据工资发放清单及支付凭证据实扣除，不需要税务部门代开发票。

农民工工资的扣除，必须坚持真实性原则，只要是真实发生的农民工工资，可以据实在企业所得税前扣除。

2019年3月1日起，《建筑工人实名制管理办法（试行）》开始施行。建筑企业所招用建筑工人的从业、培训、技能和权益保障等都将以真实身份信息认证方式进行综合管理。

《办法》明确，全面实行建筑业农民工实名制管理制度，建筑企业应与招用的建筑工人依法签订劳动合同，对其进行基本安全培训，并在相关建筑工人实名制管理平台上登记，方可允许其进入施工现场从事与建筑作业相关的活动。

对于真实发生的农民工工资，可以凭出勤记录、工资发放表、转款凭证据实在企业所得税前扣除，需要这些单据全部作为附件保存备查。

缴纳社保目前在实践中还没有强制要求。但代扣代缴个人所得税是企业的法定义务，任何单位和个人不得拒绝。

之前，农民工工资是最容易造假的地方，个别施工企业随便造个工资表，直接现金支付了。这样的结果是虚增了成本，造成国家税款流失。国家为了保障农民工的合法权益，强加了对农民工工资的管理，实行建筑工人实名制，以后造假的现象会越来越少。