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在用人单位工作16年，按照常理来说，用人单位应当缴纳社保16年才对。

如果到了退休年龄还差三年社保没有缴纳，说明单位只缴纳了12年的社保，有4年用人单位没有给缴纳。或者是单位缴纳的社保时间更短，自己还有其他方式缴纳的社保。比如，有的人是自己缴纳社保，单位没有缴纳。

不管什么情况，一个单位如果存在了16年至少还是比较规范的，可能一开始那些年度大家都不重视，因此才存在着社会保险费没缴的情况。很多单位都是从2008年1月1日劳动合同法实施，才开始陆续缴纳社保的。

这种情况下，一般用人单位只要有发放工资的凭证，在劳动者提出申请的情况下，可以对之前工作时间，也就是劳动关系存续时间的社保进行补缴。不过，一般来讲申请补缴要缴纳滞纳金，滞纳金的标准是每日5/10000，过了去10多年，钱数增加了好几倍。可能单位是不愿意缴纳的，由于超过了劳动监察维权的两年有效期，维权也确实不一定会被受理。

不过按照2017年人社部对人大代表的答复中明确，社会保险费的征缴没有有效期，经办机构一般接到超过两年的追溯期投诉以后，一般也应按程序进行受理。

不过最好的方式还是做通单位工作，有的人是通过自己承担全部费用的方式补缴的。这样自己虽然吃亏点，但能够顺顺利利办退休。

如果不能够补缴，按照现在养老保险的有关规定，只能延迟退休继续缴费，直至满足15年才能退休了，需要延迟退休三年。尤其是延迟退休的时候，需要自己缴纳灵活就业人员保险，全部承担社会保险费，算起来是不划算的。

所以，这种情况还是三思而行吧。