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关于这个问题回答如下：

1.这个问题具体原因可以咨询人力资源或者财务部门。这种情况正常情况下一是有可能是补扣了税款，就是说你以前可能财务或者人事部门在申报时可能少预扣预缴了个人所得税，现在进行了更正申报。因为一下子差额这么大，如果不是工资非常高的话不会出现这种情况。二是可能你的预扣预缴个人所得税出现了跳档情况，因为你的累计应纳税所得额提高到一个新的档次，导致适用预扣预缴税率上升，不过预扣预缴个人所得税如果金额达到7000多应该月工资薪金会很高。三是可能公司补扣了你个人应承担的其他费用。

2.至于你担心是否替他人背锅的问题，个人认为应该概率非常小。因为这个数据对你是非常透明的。一旦你发现个人所得税APP数据与实际数据相差很大自然会质疑，这件事一旦发现就会涉及偷逃国家税款问题，相信一般国企领导不会这么做，特别是采取这种方式侵害底层员工利益。

3.个人所得税APP上面的收入是你的工资薪金应发工资，不是实际到手工资，实际到手工资一般会扣除个人缴纳的三险一金、预扣预缴的个人所得税、以及不同单位可能需要扣除的其他项目。建议最好核对清楚，不要轻易在个人所得税APP进行投诉，避免给公司和税务机关带来不必要的核查工作量。