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再和税务沟通吧，税务人员的说法是错误的。理由如下：

1、依据营改增相关文件规定，房地产开发企业采取预收款方式销售自行开发的房地产项目，应在收到预收款时按照3%的预征率预缴增值税。应预缴税款按照以下公式计算：

应预缴税款=预收款÷（1+适用税率9%或征收率5%）×3%。这就是预交3%的依据。

2、贵公司是适用简易计税的老项目，依据规定，一般纳税人销售自行开发的房地产项目适用简易计税方法计税的，应按照规定的纳税义务发生时间，以当期销售额和5%的征收率计算当期应纳税额，抵减已预缴税款后，向主管国税机关申报纳税。未抵减完的预缴税款可以结转下期继续抵减。

即：应纳增值税额=不含税销售收入×5%-已预交增值税额。

所以说，税务人员的说法没有依据。其实这也是很多人的一个错误观点，认为原来已预缴3%，确认销售收入时直接补2%的差额。

建议就这个问题与税务人员继续沟通，相信可以解决。

就适用简易计税的老项目增值税的计算问题，本人曾专门写过一篇文章，如有兴趣，请点击https://www.toutiao.com/i6772895165032956419/

希望我的回答对你有所帮助。