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实际上这个说法有点不太对，公司并不能直接扣绩效，而只能通过绩效考核制度进行考评，然后根据一定的规则给予一定比例的绩效工资。那么公司能不能以考勤为理由考评，以及怎样绩效考核，应当按照以下情形。

一、首先公司得有明确的绩效考核管理制度，并且在制定时要经过民主程序，还要征得工会的同意，同时在公司范围内进行公示。同时要对员工进行培训，尽到告知的义务。

二、绩效考核制度里得包含具体的考核方法、考评标准、考评条件、以及考核结果对应的处理方式。比如条款中包括因为考勤应该如何评分。

三、针对每一个考核结果，公司都应该有对应的证据或经过员工签名。如果是公司没有理由的恶意考评扣分，那是违法的，员工可以依法维护自己的劳动权益。

四、绩效工资怎么扣，那就看公司的制度怎么规定的。不论是按照考核等级还是考核分数，都会有对应的绩效考核工资计算比例。

总的来说，公司肯定是可以通过绩效考核的方式来给予员工不同的绩效工资，前提是公司需要公平公开公正，不能把这个当作一个惩罚工具。

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