艾滋病是一种相对较新的疾病,1981年第一次被描述,直到1987年才开始有药物治疗。科学家们主要依靠进化论理论来研究HIV的过去。艾滋病毒是不断进化的种群,进化速度特别快,突变率比人类快100万倍。通过研究HIV病毒的基因序列,科学家可以发现病毒感染不同人群的方式是如何相互关联的,并重建它们的进化树或系统发生。
研究人员从刚果首都金沙萨的样本中发现的艾滋病毒被称为M的亚型,该病毒株是世界上大多数艾滋病毒感染的毒株,与最早的1959年艾滋病血液样本有很大不同。这一事实表明,在1960年前,HIV病毒已经在人类体内进行了几十年的演化。
为了研究HIV的起源,科学家采用了一种系统的方法,使用许多其他现代艾滋病毒样本的序列来构建进化树,根据计算的进化速率和一些进化的统计模型,推断出艾滋病的根源,估计所有这些不同HIV病毒序列的共同祖先的日期。数据显示,1908年是HIV病毒M型(现在全世界有3100多万人感染)的起源时间,真正的日期几乎可以肯定是在1884年到1924年间。
从历史上来看,非洲西部地区的黑猩猩有许多感染了HIV病毒前身——猴免疫缺陷病毒(SIV)。屠杀黑猩猩为食使当地猎人暴露在SIV的身上。这种病毒可能多次感染人类,但直到本世纪初,这种病毒入侵才在人类中站稳(HIV)。大约在1920年,一个猎人从喀麦隆东南的一只黑猩猩身上感染了病毒,并沿着当时的主要路线——桑加河,从森林中携带病原菌,到奥莱奥维尔(现在的刚果首都金沙萨)。直到1950年,它开始迅速繁殖,病毒继续进化,随着全球旅行的日益便利,艾滋病毒开始在非洲和世界各地传播。
1984年发表在美国医学杂志上的一项研究发现,许多早期的HIV感染都是由一位男同性恋空乘人员Dugas造成,Dugas称为“零号病人”。Dugas被描述为具备反社会的行为,故意将病毒传染给他人,或者至少是不顾后果地危害他人。根据他自己的估计,每年平均有几百个性伴侣。他声称自从1972年性行为活跃以来,在北美已经有超过2500个性伴侣。基因分析在历史上为零号患者理论提供了一些支持,在这个理论中,Dugas被认为是一群同性恋男性的一部分,他们频繁旅行外加性活跃,使艾滋病开始在世界范围内传播。