这个问题，应该在签订合同的时候就要有所准备了。如果收到预付款，就给对方开票，那么纳税义务就提前发生，企业如果当期没有那么多的进项，那么可能会引起当期的税负增加，资金流紧张，所以，企业要提前做好规划。
在合同签订的时候，可能由于对方客户比较强势，所以付完款就要求开专票。但是这种情况对于企业本身的纳税是有问题的。根据规定，如果开具了增值税发票，那么纳税义务就已经发生，企业需要有足够的资金来应对纳税的问题。所以，在谈合同的时候，应该跟对方企业就这个问题有充分的沟通，尽量争取一些利益。
如果客户比较强势，没有太多的商量余地，一定要企业提前开票，那么企业要做好几个方面的准备。
一是看看进项端，能够取得的发票，尽量及时取得。或者说对于供应商端也足够强势的，那么是不是也有可能在预付的时候，就取得发票。
二是看看客户端，尽量把各个客户的开票时间做个协调。尽量避免大量的预付款都提前开票的情况。
三是对资金状况做个盘点。看看供应商端和客户端如何进行资金的协调，保证企业资金流的稳定。
不能选择的方式，是进项不足，就到处去找进项，不管三七二十一，先把税减下来再说，这会给企业带来巨大的税务风险。当期所多交的税，是一个时间性的差异，正常来说后期出现大量的进项抵扣。当然前提条件是企业本身进项是充足的，如果本身就进项不足，那要先解决进项的问题。
总之，这样的问题，一是在合同谈判时商量好，二是在上下游之间进行好协调，三是自身加强进项票的管理，避免出现过大的差异。要避免为了降低税负，而采取的有风险的行为。