这个问题要从多方面分析。
首先要明确两点：
一、个体工商户与纳税人资格没有对应关系。个体工商户可以是小规模纳税人，也可以是一般纳税人；公司制企业可以是一般纳税人，也可以是小规模纳税人。
二、一般纳税人只能申领发票自行开具、不得申请税局代开，税率只能是对应法定税率；小规模纳税人只能申请税局代开发票（试点小规模纳税人自行开具专票的行业除外），开票税率只能是3%征收率。
情形一：个体户是一般纳税人。直接在税局申领增值税专用发票，向客户开具即可。
情形二：个体户是小规模纳税人。
1.如果后续都是大单，且年收入会超过一般纳税人认定标准。可以申请转为一般纳税人，自行给客户开票。
2.如果是偶尔大单，建议和客户协商降低含税价，客户接受3%税率的进项发票。此时可向税局申请代开增值税专用发票。
3.如果1、2项不能实现，可以请是一般纳税人的同行出面，与客户交易。（是指全过程让同行与客户交易，包括货物采购、发出；发票开具；款项收付等。绝不是请同行代开票。）
PS：以上分析基于两个前提条件：
1.对方是一般纳税人。我见过对方是小规模纳税人，死活要专票的。
2.交易必须是16%税率对应的应税项目。我也见过交易是低税率项目，对方死活要高税率发票的。